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Thema:

GenBank

(550x gelesen)

Seiten: 1 2

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Beitrag von Ashimar

10.03.2007 19:50:52

Ashimar

Profilbild von Ashimar ...

Themenstarter
Ashimar hat das Thema eröffnet...

Das Problem ist, dass die GB# und die SRS-ID nicht identisch sind... Und jetzt muss ich da einen Ausweg dafür finden...

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Beitrag von JoeNee

10.03.2007 19:51:59

JoeNee

Profilbild von JoeNee ...

kannst du deine versuche etwas genauer beschreiben?

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Beitrag von Lover1989

10.03.2007 19:58:53

Lover1989

Profilbild von Lover1989 ...

Is das sowas wie Mission Impossible hier xD ?

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Beitrag von Ashimar

10.03.2007 19:59:32

Ashimar

Profilbild von Ashimar ...

Themenstarter
Ashimar hat das Thema eröffnet...

Ich habe 5 Proteine von Macaca fascicularis...
Das habe ich in der GenBank gefunden... (Teil der Aufgabe)...

Diese Proteine brauche ich jetzt als SRS-wgetz query...
Aber das Problem ist, ich darf nicht nach Proteinname oder Organsimus suchen...
Ich muss also irgendwie die GB# in eine SRS# umwandeln...

Problem ist jetzt nur, dass ich glaube das meine Datenbank inkonsistent ist, da ich einen ganz anderen Organismus angezeigt bekomme, wenn ich nach der GB# suche...

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Beitrag von Ashimar

10.03.2007 20:00:03

Ashimar

Profilbild von Ashimar ...

Themenstarter
Ashimar hat das Thema eröffnet...

qlover: Das ist Bioinformatik... Also ja, mission impossible... *g*

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Beitrag von JoeNee

10.03.2007 20:02:09

JoeNee

Profilbild von JoeNee ...

dann bau die db besser nochma von vorn auf^^

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Beitrag von Ashimar

10.03.2007 20:03:44

Ashimar

Profilbild von Ashimar ...

Themenstarter
Ashimar hat das Thema eröffnet...

Naja, das data-file hab ich von dem TA hier bekommen...
Das sollte eigentlich schon stimmen...
Aber es verwundert mich einfach, dass ich heir ein hypothetisches Protein vom Makaken-Affen hab und ich ein Protein von der Maus angezeigt bekomme, wenn ich im INet danach suche...

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Beitrag von Lover1989

10.03.2007 20:06:02

Lover1989

Profilbild von Lover1989 ...

Bioinformatik xD omg also Informatik reicht mir =D

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